RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 KNTC1P50748 2209 aa4.76□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CPED1A4D0V7 1026 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 MEIS2O14770 477 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 WNT9BO14905 357 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 MAGEB2O15479 319 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 BUB3O43684 328 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TSPAN1O60635 241 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SEC24AO95486 1093 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CLDN14O95500 239 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 IGKV3-20P01619 116 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC166P0CW27 439 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ITGAXP20702 1163 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 MT3P25713 68 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TMOD1P28289 359 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ATP5DP30049 168 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 HSPA4P34932 840 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 BASP1P80723 227 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF628Q5EBL2 1059 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CLEC18BQ6UXF7 455 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GPR65Q8IYL9 337 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 LSMEM2Q8N112 164 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TEX9Q8N6V9 391 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PLD5Q8N7P1 536 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TEX19Q8NA77 164 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 OLIG1Q8TAK6 271 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 HVCN1Q96D96 273 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF570Q96NI8 536 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 IL17FQ96PD4 163 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CSF3RQ99062 836 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PKP4Q99569 1192 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CGREF1Q99674 301 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 HPS4Q9NQG7 708 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ASAH2Q9NR71 780 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 KIAA1456Q9P272 454 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CIDEBQ9UHD4 219 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TMCO1Q9UM00 188 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa4.75□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CENPEQ02224 2701 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TMEM150BA6NC51 233 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 E9PAM4 449 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 I3L4J1 428 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 KLK8O60259 260 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF254O75437 659 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 KRT36O76013 467 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PMS2P2O95744 297 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 EDN2P20800 178 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 STX2P32856 288 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 DDIT3P35638 169 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 EFNB1P98172 346 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 DR1Q01658 176 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ROR1Q01973 937 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF33AQ06730 810 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 TWF1Q12792 350 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 DPYSQ14117 519 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CCDC153Q494R4 210 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF766Q5HY98 468 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SPATA1Q5VX52 437 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 EXOC3L1Q86VI1 746 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 SNX32Q86XE0 403 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 POC1AQ8NBT0 407 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 C11orf65Q8NCR3 313 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 GDAP1Q8TB36 358 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CDKL2Q92772 493 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 MXRA8Q9BRK3 442 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 PI4K2AQ9BTU6 479 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 CENPOQ9BU64 300 aa4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATXN3-218ENST00000553309 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms