RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KDM1A	O60341	852 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	NME2P1	O60361	137 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FKBP9	O95302	570 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	METTL18	O95568	372 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MLYCD	O95822	493 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	NME2	P22392	152 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ACTL9	Q8TC94	416 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KRT35	Q92764	455 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SPATA13	Q96N96	652 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CHP1	Q99653	195 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	OLFM1	Q99784	485 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ALG6	Q9Y672	507 aa		11.42	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ATR	Q13535	2644 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	QSOX1	O00391	747 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	HS6ST1	O60243	411 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJB6	O75190	326 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A12	O75746	678 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PDE9A	O76083	593 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SERPINC1	P01008	464 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ERVK-10	P10266	1014 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SLC1A1	P43005	524 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ODF2	Q5BJF6	829 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF425	Q6IV72	752 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	BIVM	Q86UB2	503 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	M1AP	Q8TC57	530 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	RND1	Q92730	232 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	DRC3	Q9H069	523 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.41	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SPOP	O43791	374 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	APOC2	P02655	101 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ANXA5	P08758	320 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TFEB	P19484	476 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	AP2B1	P63010	937 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TSLP	Q969D9	159 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	RASSF1	Q9NS23	344 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		11.4	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SMTNL1	A8MU46	457 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PSTPIP1	O43586	416 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	SUN1	O94901	812 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RPN2	P04844	631 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RBP3	P10745	1247 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ERG	P11308	486 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	MEOX1	P50221	254 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RHAG	Q02094	409 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	FAM53B	Q14153	422 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	TCEAL1	Q15170	157 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	AADACL2	Q6P093	401 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	CDC20B	Q86Y33	519 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	PDSS2	Q86YH6	399 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	ELP5	Q8TE02	316 aa		11.39	□□□□□ -0.59
BBS1-222	ENST00000533557	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms