RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 SPINT3P49223 89 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 LMAN1P49257 510 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 GEMP55040 296 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 BMPR2Q13873 1038 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 TBCCQ15814 346 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 CCDC38Q502W7 563 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 FCRL6Q6DN72 434 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 RANBP10Q6VN20 620 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.31□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 HEATR4Q86WZ0 1026 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 KRT73Q86Y46 540 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 SLC25A45Q8N413 288 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 EID2Q8N6I1 236 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 BEND2Q8NDZ0 799 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 DKK4Q9UBT3 224 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 E7EVH7 732 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 TRIM38O00635 465 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 SLC30A4O14863 429 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 CASC3O15234 703 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A9O60656 530 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 AVILO75366 819 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 URI1O94763 535 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 CER1O95813 267 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 KRT14P02533 472 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 APRTP07741 180 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 PRSS56P0CW18 603 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A6P19224 532 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A1P22309 533 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A4P22310 534 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 MSNP26038 577 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A3P35503 534 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A5P35504 534 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 GPS1Q13098 491 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 POU6F1Q14863 301 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 ALG11Q2TAA5 492 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 P3H1Q32P28 736 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 DEPDC1Q5TB30 811 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 KCTD11Q693B1 232 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 IL27RAQ6UWB1 636 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 ZNF627Q7L945 461 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 TTC30BQ8N4P2 665 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 ACTRT1Q8TDG2 376 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 SAP25Q8TEE9 199 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 OR1E3Q8WZA6 343 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF566Q969W8 418 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 SKA1Q96BD8 255 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 RTP4Q96DX8 246 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 PDXPQ96GD0 296 aa7.3□□□□□ -1.24
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UBE2B-204ENST00000504431 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 CLPBQ9H078 707 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 MAGEE1Q9HCI5 957 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 FGF22Q9HCT0 170 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-204ENST00000504431 LRP4O75096 1905 aa7.3□□□□□ -1.24
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