RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485349.5

SKIV2L-211, Transcript of Ski2 like RNA helicase, humanhuman

TSL 2

Gene SKIV2L, Length 734 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2L-211ENST00000485349 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SHISA5Q8N114 240 aa16.05■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ASB11Q8WXH4 323 aa16.05■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNJ9Q92806 393 aa16.05■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.05■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TRAV17A0A0B4J275 112 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 KIF5CO60282 957 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 JRKO75564 520 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 BMP10O95393 424 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 KRT14P02533 472 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 STSP08842 583 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 MPC1LP0DKB6 136 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ITGAMP11215 1152 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 IMPA1P29218 277 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 KCNK10P57789 538 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ABATP80404 500 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TMEM205Q6UW68 189 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 PRSS41Q7RTY9 318 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 FJX1Q86VR8 437 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TRIM58Q8NG06 486 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 CD200R1Q8TD46 325 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SERPINB12Q96P63 405 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 GPR21Q99679 349 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.04■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 MYO7BQ6PIF6 2116 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 H7BY64 318 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 GFYI3L273 518 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 PCDH17O14917 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 WFS1O76024 890 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 WDPCPO95876 746 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 MLNP12872 115 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 MPP1Q00013 466 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 RELAQ04206 551 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 FAM53BQ14153 422 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 INAQ16352 499 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 NR4A3Q92570 626 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 HAS2Q92819 552 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 DHRS7Q9Y394 339 aa16.03■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 FBN2P35556 2912 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SDR42E2A6NKP2 422 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TXNDC9O14530 226 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 AVPR1BP47901 424 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 TBPL1P62380 186 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 LANCL3Q6ZV70 420 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 MACROD1Q9BQ69 325 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 VN1R1Q9GZP7 353 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 SH2B3Q9UQQ2 575 aa16.02■□□□□ 0.16
SKIV2L-211ENST00000485349 AKAP9Q99996 3911 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 A0A1B0GUH1 482 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGEB16A2A368 324 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 ZBTB14O43829 449 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGEA3P43357 314 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 ZNF33BQ06732 778 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 NDUFA9Q16795 377 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 LONRF1Q17RB8 773 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MINDY4Q4G0A6 757 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MCUQ8NE86 351 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 MS4A14Q96JA4 679 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 TUBB6Q9BUF5 446 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 RNF32Q9H0A6 362 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.01■□□□□ 0.15
SKIV2L-211ENST00000485349 NEU2Q9Y3R4 380 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms