RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 FAM153BP0C7A2 387 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A3P40879 764 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 OR1D4P47884 311 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A12P48065 614 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 FOXL2P58012 376 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 MUM1Q2TAK8 710 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 FAM153CQ494X1 144 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 CATSPEREQ5SY80 951 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 OVCH1Q7RTY7 1134 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 GPSM1Q86YR5 675 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 TMEM151BQ8IW70 566 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SLC5A11Q8WWX8 675 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 NEIL2Q969S2 332 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 THAP11Q96EK4 314 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 CABS1Q96KC9 395 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A14Q9Y267 594 aa19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 TXNDC9O14530 226 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 TAPBPO15533 448 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 C2P06681 752 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 CD63P08962 238 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 BCL6P41182 706 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 GDF5P43026 501 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 CCR8P51685 355 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 POLE2P56282 527 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 CDKL4Q5MAI5 379 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 GARNL3Q5VVW2 1013 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 THAP4Q8WY91 577 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 FKBP10Q96AY3 582 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 NXNL1Q96CM4 212 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 TM4SF19Q96DZ7 209 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 PAFAH2Q99487 392 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SARGQ9BW04 601 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A1Q9H2B4 701 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 NMRAL1Q9HBL8 299 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 ZNF304Q9HCX3 659 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SNX15Q9NRS6 342 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 PADI2Q9Y2J8 665 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 ACOT9Q9Y305 439 aa19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 MAU2Q9Y6X3 613 aa19.96■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 C1QL1O75973 258 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ALBP02768 609 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 STATHP02808 62 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
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ACTB-211ENST00000480301 IRF9Q00978 393 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PRMT9Q6P2P2 845 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 OR2Y1Q8NGV0 311 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 STAG3L4Q8TBR4 150 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 TSNARE1Q96NA8 513 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 TMEM79Q9BSE2 394 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 TXLNGYQ9BZA5 131 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ALG9Q9H6U8 611 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PELI2Q9HAT8 420 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 DYRK1BQ9Y463 629 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 A0A087X1B8 175 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 FOXS1O43638 330 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 UMODP07911 640 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 INHBAP08476 426 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ABHD2P08910 425 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 GGT5P36269 586 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 FOLR3P41439 243 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PMS2P54278 862 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 SSPNQ14714 243 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 NKG7Q16617 165 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 TEX35Q5T0J7 233 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 SULT1C3Q6IMI6 304 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 NXPE4Q6UWF7 544 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 CCDC91Q7Z6B0 441 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 TCAIMQ8N3R3 496 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 MFSD9Q8NBP5 474 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 PDPRQ8NCN5 879 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ZNF740Q8NDX6 193 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 DCAKDQ8WVC6 231 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 KCTD4Q8WVF5 259 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ATOH8Q96SQ7 321 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 SPSB2Q99619 263 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 MACROD1Q9BQ69 325 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-211ENST00000480301 ADNPQ9H2P0 1102 aa19.94■□□□□ 0.78
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