RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 WASH3PC4AMC7 463 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 H3BNX3 289 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF10BO14763 440 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 WASH2PQ6VEQ5 465 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 SLC9B2Q86UD5 537 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 KCNA7Q96RP8 456 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 SQORQ9Y6N5 450 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 SLIT2O94813 1529 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 TEX46H3BTG2 121 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 FCER2P06734 321 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF224Q9NZL3 707 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A0D9SEW6 157 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF234Q14588 700 aa21.75■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 C4orf46Q504U0 113 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PRQ8 180 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 ANXA8P13928 327 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 SMYD5Q6GMV2 418 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 PEX12O00623 359 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 MERTKQ12866 999 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.076e-6■■■■□ 22.6
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 OR2L8Q8NGY9 312 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 TMBIM1Q969X1 311 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 CGREF1Q99674 301 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 C3P01024 1663 aa21.73■■□□□ 1.07
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