RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329151.5

TMEM54-201, Transcript of transmembrane protein 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM54, Length 871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54-201ENST00000329151 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 E7ENX8 843 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ZG16O60844 167 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 F10P00742 488 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 HRH2P25021 359 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CXCR5P32302 372 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 SOX11P35716 441 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CLCN7P51798 805 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TAP2Q03519 686 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 RELAQ04206 551 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 FAM53BQ14153 422 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF425Q6IV72 752 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PRELID2Q8N945 189 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 NR4A3Q92570 626 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 KCNJ9Q92806 393 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 COMMD10Q9Y6G5 202 aa22.12■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 HAT1O14929 419 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 RASAL1O95294 804 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 STSP08842 583 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MLNP12872 115 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 RBPJQ06330 500 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF33BQ06732 778 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CTBP1Q13363 440 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PLD3Q8IV08 490 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 LMNTD2Q8IXW0 634 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 AMER3Q8N944 861 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ABI3Q9P2A4 366 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 COPG2Q9UBF2 871 aa22.11■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PRSS44E7EML9 344 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 GOLGA8MH3BSY2 632 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 H7BY64 318 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 GRK3P35626 688 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 SYT16Q17RD7 645 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 UGT3A1Q6NUS8 523 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ASB11Q8WXH4 323 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PSMF1Q92530 271 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MARVELD3Q96A59 401 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PRAP1Q96NZ9 151 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 LRBAP50851 2863 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 A0A1W2PQ72 361 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 A8MUI8 341 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 H0YIG0 161 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 FOXS1O43638 330 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 WDPCPO95876 746 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ITGAMP11215 1152 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 RGS4P49798 205 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CASP6P55212 293 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 KCNK10P57789 538 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 OR9A4Q8NGU2 314 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MOCOSQ96EN8 888 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 GPR21Q99679 349 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 RNF32Q9H0A6 362 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 STMN3Q9NZ72 180 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ENTPD4Q9Y227 616 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 DHRS7Q9Y394 339 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ABCA12Q86UK0 2595 aa22.09■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 OR5H15A6NDH6 313 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 P2RX6O15547 441 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 KIF5CO60282 957 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 STATHP02808 62 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CELA2AP08217 269 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 SLC1A2P43004 574 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MAGEA6P43360 314 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 PCOLCEQ15113 449 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 BTBD16Q32M84 506 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 MTFR2Q6P444 385 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 TMEM205Q6UW68 189 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 ZNF662Q6ZS27 426 aa22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TMEM54-201ENST00000329151 CPNE9Q8IYJ1 553 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms