RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299333.7

SCN3B-201, Transcript of sodium voltage-gated channel beta subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCN3B, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3B-201ENST00000299333 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.48□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 KCT2Q8NC54 265 aa14.48□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ASPNQ9BXN1 380 aa14.48□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SH3PXD2BA1X283 911 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MASP1P48740 699 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 DSTNP60981 165 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 DSG2Q14126 1118 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 DTX3Q8N9I9 347 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CAMK1GQ96NX5 476 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GSTM3P21266 225 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GPX6P59796 221 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SLC25A36Q96CQ1 311 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 HMCESQ96FZ2 354 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 VPS25Q9BRG1 176 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 COPZ2Q9P299 210 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 WASH3PC4AMC7 463 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 STBD1O95210 358 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 FPR1P21462 350 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 RORAP35398 523 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MAP2K3P46734 347 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 PDX1P52945 283 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CDH11P55287 796 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 PRMT2P55345 433 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MAPK14Q16539 360 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 AKR1A1P14550 325 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 IL12BP29460 328 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GRM5P41594 1212 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CYP1B1Q16678 543 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ESX1Q8N693 406 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ZNF675Q8TD23 568 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 AKT1S1Q96B36 256 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MUS81Q96NY9 551 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GNG13Q9P2W3 67 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 TECPR2O15040 1411 aa14.47□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 AGAP5A6NIR3 686 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CMPK1P30085 196 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 IKBKEQ14164 716 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ZFPM1Q8IX07 1006 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MS4A12Q9NXJ0 267 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CLDN4O14493 209 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SLC19A2O60779 497 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ESR1P03372 595 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 RHOQP17081 205 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 UFM1P61960 85 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 RABL3Q5HYI8 236 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 HES5Q5TA89 166 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 GPR135Q8IZ08 494 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SCML4Q8N228 414 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 IL31RAQ8NI17 732 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SMURF1Q9HCE7 757 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 ARL5AQ9Y689 179 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CNTNAP1P78357 1384 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 RFPL2O75678 378 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 BCHEP06276 602 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 C8GP07360 202 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 PNLIPRP1P54315 467 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.46□□□□□ -0.09
SCN3B-201ENST00000299333 CCDC74BQ96LY2 380 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms