RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 MARCH5Q9NX47 278 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SSR3Q9UNL2 185 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GADD45GO95257 159 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRLP01236 227 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN19P0C672 248 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 AMD1P17707 334 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TXNDC8Q6A555 127 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SAPCD2Q86UD0 394 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C17orf64Q86WR6 236 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TCEAL8Q8IYN2 117 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GJD3Q8N144 294 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GANCQ8TET4 914 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 AP3S1Q92572 193 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 REEP4Q9H6H4 257 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 IL36AQ9UHA7 158 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF639Q9UID6 485 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TESMINQ9Y4I5 508 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ACOX3O15254 700 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NRIP1P48552 1158 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 USP51Q70EK9 711 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF367Q7RTV3 350 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D15Q8TC07 691 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 USP7Q93009 1102 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ACPTQ9BZG2 426 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ABCG8Q9H221 673 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 EHD3Q9NZN3 535 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BTBD3Q9Y2F9 522 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OR2AG2A6NM03 316 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TAF4O00268 1085 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ADH1CP00326 375 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SHMT2P34897 504 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF45Q02386 682 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CLCA4Q14CN2 919 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 HKDC1Q2TB90 917 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 YAF2Q8IY57 180 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LGI4Q8N135 537 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ABHD11Q8NFV4 315 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 BBS4Q96RK4 519 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RNF6Q9Y252 685 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CFL2Q9Y281 166 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PTPRFP10586 1907 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 J3QRK9 145 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 LEFTY2O00292 366 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SNPHO15079 494 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SH3BGRLO75368 114 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CXCL14O95715 111 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PTPN2P17706 415 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF763Q0D2J5 394 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NPRL3Q12980 569 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PROX2Q3B8N5 592 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF404Q494X3 552 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DCST1Q5T197 706 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TEX37Q96LM6 180 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MKLN1Q9UL63 735 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RAB23Q9ULC3 237 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OTOFQ9HC10 1997 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRB8 838 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TAPBPO15533 448 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OR10H3O60404 316 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PCSK6P29122 969 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PCGF2P35227 344 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SPINT3P49223 89 aa8.56□□□□□ -1.04
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