RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF605Q86T29 641 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 C7orf57Q8NEG2 295 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PKP4Q99569 1192 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DUSP26Q9BV47 211 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 KCNH6Q9H252 994 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TBCCD1Q9NVR7 557 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SNPHO15079 494 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SCAMP1O15126 338 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SULT1C4O75897 302 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CKMT1AP12532 417 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ETV3P41162 512 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CLDN8P56748 225 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ABHD18Q0P651 414 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TUBA3CQ13748 450 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SLC5A8Q8N695 610 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM203Q969S6 136 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 OTULINQ96BN8 352 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CASD1Q96PB1 797 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CORO1BQ9BR76 489 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 C11orf16Q9NQ32 467 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SLC6A14Q9UN76 642 aa12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 H3BN98 237 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CCNDBP1O95273 360 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 INHBBP09529 407 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA0040Q15053 153 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 FKBP10Q96AY3 582 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF556Q9HAH1 456 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ADPRHL2Q9NX46 363 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 C5AR2Q9P296 337 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 VPS29Q9UBQ0 182 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF639Q9UID6 485 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CCL27Q9Y4X3 112 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 INPPL1O15357 1258 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 YY2O15391 372 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CYP2A7P20853 494 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 VPS37AQ8NEZ2 397 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 DOK1Q99704 481 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 SERHLQ9NQF3 203 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM184CQ9NVA4 438 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF236Q9UL36 1845 aa12.96□□□□□ -0.33
TMOD1-201ENST00000259365 PRAMEF4O60810 478 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DOC2AQ14183 400 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DUOXA1Q1HG43 343 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ATG9BQ674R7 924 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NEK10Q6ZWH5 1172 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM159Q96B96 161 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RPS6KA6Q9UK32 745 aa12.96□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM64CA6NLI5 447 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 KCNK5O95279 499 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 EPHB3P54753 998 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GBX1Q14549 363 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 COX20Q5RI15 118 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 USP45Q70EL2 814 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NFKBIDQ8NI38 313 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NRTNQ99748 197 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SIAEQ9HAT2 523 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 EHD3Q9NZN3 535 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PLAGL1Q9UM63 463 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ERVK-11Q9UQG0 969 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DNAH14Q0VDD8 3507 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TLL1O43897 1013 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MAPK1P28482 360 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GRK3P35626 688 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 FKBP1BP68106 108 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DMPKQ09013 629 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms