RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD46Q86W74 232 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FLCNQ8NFG4 579 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 LATS2Q9NRM7 1088 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL42Q9P2K6 505 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF221Q9UK13 617 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CFL2Q9Y281 166 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZW10O43264 779 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 RHOCP08134 193 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ANXA5P08758 320 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TCTN1Q2MV58 587 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 IQCCQ4KMZ1 466 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FUT10Q6P4F1 479 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 MACC1Q6ZN28 852 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC190Q86UF4 302 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SYTL1Q8IYJ3 562 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SELENOMQ8WWX9 145 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 NUAK2Q9H093 628 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.12■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 A8MVJ9 347 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 IDH3BO43837 385 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FZD6O60353 706 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TLR5O60602 858 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ENGP17813 658 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 NR4A2P43354 598 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 NEK2P51955 445 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PRMT2P55345 433 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 COPZ1P61923 177 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC14A1Q13336 389 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 C6orf183Q5T699 404 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 VTCN1Q7Z7D3 282 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PTOV1Q86YD1 416 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 GGHQ92820 318 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 C7orf34Q96L11 122 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FCRL1Q96LA6 429 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 EHD3Q9NZN3 535 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 MTMR11A4FU01 709 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 A8MU76 341 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 KMOO15229 486 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PIK3CBP42338 1070 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF33BQ06732 778 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF367Q7RTV3 350 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 UBE2FQ969M7 185 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TMCO6Q96DC7 493 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TSSK3Q96PN8 268 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.11■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A075B6Q4 140 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PITPNM1O00562 1244 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FPGTO14772 594 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXA2O43364 376 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 RGS6P49758 472 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 C21orf58P58505 322 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR17Q13304 367 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CLIP4Q8N3C7 705 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PANX1Q96RD7 426 aa22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ADAMDEC1O15204 470 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 DIRAS1O95057 198 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ITGALP20701 1170 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TIE1P35590 1138 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNQ1P51787 676 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 IRF3Q14653 427 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 RTP2Q5QGT7 225 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms