RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	HBEGF	Q99075	208 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABCG4	Q9H172	646 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	EHD1	Q9H4M9	534 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	POMT2	Q9UKY4	750 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	HDAC3	O15379	428 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TGDS	O95455	350 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	JUP	P14923	745 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PVR	P15151	417 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PNLIP	P16233	465 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CMPK1	P30085	196 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	GFER	P55789	205 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	GPLD1	P80108	840 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	KANK2	Q63ZY3	851 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAVS	Q7Z434	540 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM129C	Q86XR2	697 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	NUF2	Q9BZD4	464 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		8.81	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PROB1	E7EW31	1015 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF195	O14628	629 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUX1	O43812	170 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNDBP1	O95273	360 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM107A	O95990	144 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD1C	P29017	333 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	HMOX2	P30519	316 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNF4A	P41235	474 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRIA3	P42263	894 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	HTR6	P50406	440 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSNK1G2	P78368	415 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CFHR1	Q03591	330 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLD3	Q8IV08	490 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFI44	Q8TCB0	444 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TGM7	Q96PF1	710 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	BTRC	Q9Y297	605 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0G2JND7	137 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FEZF1	A0PJY2	475 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAMEF10	O60809	474 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CSF2RB	P32927	897 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	NEK2	P51955	445 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	AQP5	P55064	265 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	SGO1	Q5FBB7	561 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAXD	Q8IW45	347 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	MAP3K3	Q99759	626 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	KLHL3	Q9UH77	587 aa		8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ULK1	O75385	1050 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	CKMT2	P17540	419 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRG2	Q64ET8	278 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF425	Q6IV72	752 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF175	Q8N4F7	328 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR7G3	Q8NG95	312 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAR2	Q96K12	515 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	FRG2B	Q96QU4	278 aa		8.79	□□□□□ -1
EFTUD2-223	ENST00000592576	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		8.79	□□□□□ -1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms