RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 GRIN2CQ14957 1233 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0040Q15053 153 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SLC36A3Q495N2 470 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CITED4Q96RK1 184 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TCF25Q9BQ70 676 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HOXD1Q9GZZ0 328 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 RASAL1O95294 804 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 NTRK1P04629 796 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PDHA2P29803 388 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PIGAP37287 484 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 USP45Q70EL2 814 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PTGES3LE9PB15 166 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 H0Y858 1186 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 UPK1AO00322 258 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GPIP06744 558 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ANXA6P08133 673 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HLA-EP13747 358 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HPCAL1P37235 193 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TSPAN7P41732 249 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 BDKRB1P46663 353 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CHRNB3Q05901 458 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CHIT1Q13231 466 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 IER5LQ5T953 404 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SULT1C3Q6IMI6 304 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MROQ9BYG7 248 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 B3GALNT1O75752 331 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 BMP10O95393 424 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 OLFM2O95897 454 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SERPINA1P01009 418 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PRKACAP17612 351 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PSMA3P25788 255 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 VAC14Q08AM6 782 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HTR3DQ70Z44 454 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SAMD11Q96NU1 681 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 NOTCH4Q99466 2003 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ASAH2Q9NR71 780 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 C1orf109Q9NX04 203 aa14.6□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ALBP02768 609 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H2ADP20671 130 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 AGXTP21549 392 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HTR1EP28566 365 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SPINT3P49223 89 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GTF2H3Q13889 308 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MEP1AQ16819 746 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 DOK6Q6PKX4 331 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MACC1Q6ZN28 852 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 FLCNQ8NFG4 579 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 GIMAP1Q8WWP7 306 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TBC1D20Q96BZ9 403 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ING2Q9H160 280 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 NEK6Q9HC98 313 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TBX21Q9UL17 535 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CDH7Q9ULB5 785 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.59□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 WASH3PC4AMC7 463 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms