RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A0J9YVX5 310 aa31.73■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2B3O76000 313 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNAZP19086 355 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 AGTR2P50052 363 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSNK1G2P78368 415 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC18A2Q05940 514 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDC16Q13042 620 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM126BQ8IUX1 230 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SELENOSQ9BQE4 189 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 E7EQ34 232 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BMH7 237 aa31.72■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SMIM24O75264 130 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 STK17BO94768 372 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SBK3P0C264 359 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCR8P51685 355 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP85LQ5SZL2 805 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf33Q8N1A6 199 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRY4Q9C004 299 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASB1Q9Y576 335 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 HAT1O14929 419 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCRG1O75711 98 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRHR1P34998 444 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCTE1Q5JU00 501 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf46Q6P387 395 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4K1Q8NGD4 311 aa31.71■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EPI3 171 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 COPEO14579 308 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA0754O94854 1291 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF28P17035 718 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRK3P35626 688 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDK4Q16654 411 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CATSPEREQ5SY80 951 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRMPD2BQ6IN97 320 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS11BQ86T26 416 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF285Q96NJ3 590 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2A5Q96R48 311 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PELI2Q9HAT8 420 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENAMQ9NRM1 1142 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRAK4Q9NWZ3 460 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRID1Q9ULK0 1009 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa31.7■■■□□ 2.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 STX16O14662 325 aa31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZFAND4Q86XD8 727 aa31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF248Q8NDW4 579 aa31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF21BQ96EK2 531 aa31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 MKS1Q9NXB0 559 aa31.7■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLGAP3O95886 979 aa31.69■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TAC1P20366 129 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 NXPE4Q6UWF7 544 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 PROSER1Q86XN7 944 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNX31Q8N9S9 440 aa31.69■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 CASP8Q14790 479 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC153Q494R4 210 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 DTX1Q86Y01 620 aa31.68■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SENP1Q9P0U3 644 aa31.68■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa31.67■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-209ENST00000574205 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa31.67■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NTRK1P04629 796 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4N4Q8N0Y3 316 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 THAP11Q96EK4 314 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOPT1Q96IL0 206 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMCNQ9ULC0 261 aa31.67■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 FEZF1A0PJY2 475 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YGG7 62 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF749O43361 778 aa31.66■■■□□ 2.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa31.66■■■□□ 2.66
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