RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568870.1

TCF25-223, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 2

Gene TCF25, Length 263 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-223	ENST00000568870	XKR6	Q5GH73	641 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PAQR7	Q86WK9	346 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PELI2	Q9HAT8	420 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FAM60A	Q9NP50	221 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870		A0A0J9YVX5	310 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FEZF1	A0PJY2	475 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	TRIM13	O60858	407 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	JMJD7	P0C870	316 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	HGF	P14210	728 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FOLR1	P15328	257 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	EPOR	P19235	508 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CCNG1	P51959	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PPP2R2A	P63151	447 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CSNK1G2	P78368	415 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CLC	Q05315	142 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	CHIT1	Q13231	466 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GPR19	Q15760	415 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ZNF425	Q6IV72	752 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	PLD3	Q8IV08	490 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	D2HGDH	Q8N465	521 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	ACTR8	Q9H981	624 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TCF25-223	ENST00000568870	OR7A17	O14581	309 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	CTSV	O60911	334 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	CCL4	P13236	92 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	ITIH1	P19827	911 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	NR1D1	P20393	614 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	MAPK10	P53779	464 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	SLC18A1	P54219	525 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	ACY1	Q03154	408 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	TUBB3	Q13509	450 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	DOC2A	Q14183	400 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	ATG9B	Q674R7	924 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	MDM1	Q8TC05	714 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	OR6C1	Q96RD1	312 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	PISD	Q9UG56	409 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	SATB2	Q9UPW6	733 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870		H3BQF6	201 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	BIRC5	O15392	142 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	OR1F1	O43749	312 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	MLYCD	O95822	493 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	OTC	P00480	354 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	CXCR2	P25025	360 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	CCR10	P46092	362 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	NAA20	P61599	178 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	REEP5	Q00765	189 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TCF25-223	ENST00000568870	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28

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