RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528320.5

PUF60-212, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-212ENST00000528320 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 KPNA5O15131 536 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 STK17BO94768 372 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 PRKAR1AP10644 381 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 PREPP48147 710 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SLC1A6P48664 564 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CDKN2DP55273 166 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 MAP7Q14244 749 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CSHL1Q14406 222 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 IL11RAQ14626 422 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SETDB1Q15047 1291 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 IGFBP7Q16270 282 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CGB2Q6NT52 195 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 C16orf46Q6P387 395 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CCDC121Q6ZUS5 278 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 KMT5CQ86Y97 462 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 D2HGDHQ8N465 521 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 C10orf82Q8WW14 230 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 NXNL1Q96CM4 212 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 NDNQ99608 321 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 NRTNQ99748 197 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 DRC3Q9H069 523 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 MRGBPQ9NV56 204 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 TLCD2A6NGC4 264 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CCT8L1PA6NM43 557 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 E5RI56 91 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 MSL3P1P0C860 447 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CBSLP0DN79 551 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CD1DP15813 335 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SAT1P21673 171 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CBSP35520 551 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 RGS4P49798 205 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 KIAA1191Q96A73 305 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CNDP1Q96KN2 507 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 MAP3K3Q99759 626 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 MECRQ9BV79 373 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 FAM8A1Q9UBU6 413 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 POMT2Q9UKY4 750 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 BTRCQ9Y297 605 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 DHRS7Q9Y394 339 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 BTN3A3O00478 584 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 KERAO60938 352 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SMIM24O75264 130 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ATP5HO75947 161 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 IPO13O94829 963 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SLCO2B1O94956 709 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 FTH1P02794 183 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SBK3P0C264 359 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 OR56A5P0C7T3 313 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 GP1BBP13224 206 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 FOLR1P15328 257 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ZNF28P17035 718 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 TCN2P20062 427 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 AOAHP28039 575 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 FMO4P31512 558 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CCR7P32248 378 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SEPHS1P49903 392 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 IL2P60568 153 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 DLG1Q12959 904 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 PRKAA1Q13131 559 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 RCN2Q14257 317 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 IRGCQ6NXR0 463 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 ISCA2Q86U28 154 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-212ENST00000528320 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms