RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493007.1

PITPNB-210, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein beta, humanhuman

TSL 3

Gene PITPNB, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNB-210ENST00000493007 C17orf64Q86WR6 236 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 GPSM1Q86YR5 675 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 KIAA1191Q96A73 305 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 PTERQ96BW5 349 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 PYCR2Q96C36 320 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 NXNL1Q96CM4 212 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 CRELD1Q96HD1 420 aa8.7□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 CCDC77Q9BR77 488 aa8.7□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 EFHD1Q9BUP0 239 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 ZNF180Q9UJW8 692 aa8.7□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 RNF112Q9ULX5 631 aa8.7□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 KRT37O76014 449 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 MR1Q95460 341 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 OR2A5Q96R48 311 aa8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 OR4K3Q96R72 315 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 PRORYQ9H606 182 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 STARD5Q9NSY2 213 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 CD274Q9NZQ7 290 aa8.69□□□□□ -1.02
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PITPNB-210ENST00000493007 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 IL17BQ9UHF5 180 aa8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 KCND3Q9UK17 655 aa8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 CROTQ9UKG9 612 aa8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 CACNA1BQ00975 2339 aa8.68□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 FITM1A5D6W6 292 aa8.68□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 C21orf140B9A014 251 aa8.68□□□□□ -1.02
PITPNB-210ENST00000493007 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.68□□□□□ -1.02
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