RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479023.5

FGD4-205, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 4

Gene FGD4, Length 535 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-205	ENST00000479023	BAK1	Q16611	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TLK2	Q86UE8	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	EXT2	Q93063	718 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CSF3R	Q99062	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MEIS2	O14770	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NDUFS7	O75251	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CRCP	O75575	148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CIB2	O75838	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NDUFB4	O95168	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	LCA5L	O95447	670 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CSTA	P01040	98 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TPO	P07202	933 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FH	P07954	510 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	GSTA2	P09210	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	COX7A2	P14406	83 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	VCL	P18206	1134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ABCD3	P28288	659 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	MAPK4	P31152	587 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	BMX	P51813	675 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	GAS1	P54826	345 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	STX17	P56962	302 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	IL24	Q13007	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SNTA1	Q13424	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	PON2	Q15165	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	NOTUM	Q6P988	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	FAM171B	Q6P995	826 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	SZRD1	Q7Z422	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FGD4-205	ENST00000479023	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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