RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 GGT5P36269 586 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ACY1Q03154 408 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PTCHD3Q3KNS1 767 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FIGLAQ6QHK4 219 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM129CQ86XR2 697 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 BMPERQ8N8U9 685 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 EXT2Q93063 718 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TAAR9Q96RI9 348 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DPH1Q9BZG8 443 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GNT4Q9C0J1 378 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RABEP2Q9H5N1 569 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ASCL3Q9NQ33 180 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FBXO8Q9NRD0 319 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 THSD1Q9NS62 852 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 OCIAD1Q9NX40 245 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC39A1Q9NY26 324 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 WWOXQ9NZC7 414 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PISDQ9UG56 409 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 UBXN8O00124 270 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 AGRPO00253 132 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MSL3P1P0C860 447 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CCL4P13236 92 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGP20916 626 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GRIA3P42263 894 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TMPRSS3P57727 454 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RAB15P59190 212 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CXADRP78310 365 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC18A2Q05940 514 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 C17orf64Q86WR6 236 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM20CQ8IXL6 584 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PARP9Q8IXQ6 854 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNE4Q8WWG9 221 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL25Q9H0H3 589 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SNX7Q9UNH6 387 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ANKRD12Q6UB98 2062 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TAPBPO15533 448 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK8O60259 260 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 COQ9O75208 318 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GLRA3O75311 464 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 C1QL1O75973 258 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TNFSF15O95150 251 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MTHFD2P13995 350 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 HGFP14210 728 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FOLR1P15328 257 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 NPPBP16860 134 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KRT4P19013 534 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GCKP35557 465 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC6A12P48065 614 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MAPK10P53779 464 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SH3BP2P78314 561 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 IL11RAQ14626 422 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ZIC1Q15915 447 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM164Q5U3C3 297 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC121Q6ZUS5 278 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TRABD2AQ86V40 505 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PYCR2Q96C36 320 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC46A1Q96NT5 459 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DPH7Q9BTV6 452 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FANCEQ9HB96 536 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM184CQ9NVA4 438 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM216Q9P0N5 145 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SENP1Q9P0U3 644 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 XPR1Q9UBH6 696 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PCM1Q15154 2024 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXO6A8MYZ6 492 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ERVH48-1M5A8F1 160 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 COPEO14579 308 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SMIM24O75264 130 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 STK16O75716 305 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 WDR47O94967 919 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PRB1P04280 392 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 EBLN1P0CF75 366 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GFAPP14136 432 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ITIH1P19827 911 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CRHR1P34998 444 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ETV5P41161 510 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RHDQ02161 417 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FOXM1Q08050 763 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms