RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442971.1

SSXP3-201, Transcript of SSX family pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SSXP3, Length 1,300 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSXP3-201ENST00000442971 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 MAML1Q92585 1016 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 NT5C3BQ969T7 300 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 EPSTI1Q96J88 318 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 GSDMAQ96QA5 445 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TBCBQ99426 244 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 YIPF2Q9BWQ6 316 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 WWP1Q9H0M0 922 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ESM1Q9NQ30 184 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TMEM51Q9NW97 253 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TRPC4Q9UBN4 977 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.61□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 H3BRJ5 948 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FFAR3O14843 346 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TIMM23O14925 209 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 GPR42O15529 346 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 KLF4O43474 513 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 HCN1O60741 890 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PRAMEF11O60813 436 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ATP6AP2O75787 350 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 GLSO94925 669 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PGLSO95336 258 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 CLDN7O95471 211 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TUBB4AP04350 444 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 GTF2H1P32780 548 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PRCPP42785 496 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TRAF2Q12933 501 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 NFE2L1Q14494 772 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 SLC10A1Q14973 349 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FAM131BQ86XD5 332 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 NDUFAF2Q8N183 169 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 SVOPLQ8N434 492 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 OR2M7Q8NG81 312 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FBXW5Q969U6 566 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 NOD2Q9HC29 1040 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.6□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 A0A0J9YY10 115 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 A0A1W2PP18 115 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PES1O00541 588 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 KPNA5O15131 536 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 LILRA1O75019 489 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 UGT2B7P16662 529 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PTPN6P29350 595 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 SPINT3P49223 89 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PCYT1AP49585 367 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 DIO3P55073 304 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FOXF2Q12947 444 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 PDCLQ13371 301 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ME3Q16798 604 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 P3H1Q32P28 736 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TCTE1Q5JU00 501 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 METRNLQ641Q3 311 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 OLFML1Q6UWY5 402 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 SLC26A9Q7LBE3 791 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 GPSM1Q86YR5 675 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 GLYATL1Q969I3 302 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 NTAN1Q96AB6 310 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 C3orf49Q96BT1 292 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 OR2A14Q96R47 310 aa6.59□□□□□ -1.35
SSXP3-201ENST00000442971 TBX15Q96SF7 602 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms