RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBA3CQ13748 450 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TREML2Q5T2D2 321 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHDC10Q6PID8 442 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CEP68Q76N32 757 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PAQR7Q86WK9 346 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PLD4Q96BZ4 506 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX27Q96L92 541 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DEFB118Q96PH6 123 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC28A3Q9HAS3 691 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TRPV4Q9HBA0 871 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FZD4Q9ULV1 537 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MAFFQ9ULX9 164 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF536O15090 1300 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CCL16O15467 120 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CSN2P05814 226 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FOSL2P15408 326 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ENGP17813 658 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HK1P19367 917 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FPR1P21462 350 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CD72P21854 359 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 VAMP1P23763 118 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIA1P42261 906 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ALG10Q5BKT4 473 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF627Q7L945 461 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM74Q86UV6 250 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM73Q86UV7 250 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK15Q96Q40 435 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC38A3Q99624 504 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35A5Q9BS91 424 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 P2RX2Q9UBL9 471 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RHPN2P1A8MT19 583 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 L7N2F9 121 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CCRL2O00421 344 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ENTPD6O75354 484 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TGFB1P01137 390 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTT2P0CG29 244 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GGT5P36269 586 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DGKGP49619 791 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SMSP52788 366 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS24P62847 133 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 VAMP2P63027 116 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP1BP68106 108 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ABHD18Q0P651 414 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM189A2Q15884 450 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF404Q494X3 552 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00471Q8N535 108 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2L2Q8NH16 312 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SETD6Q8TBK2 473 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNC2Q96PR1 638 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ITPAQ9BY32 194 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2AG1Q9H205 316 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MKLN1Q9UL63 735 aa10.72□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBC2A0A5B9 178 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 KLF11O14901 512 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DLX3O60479 287 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RCBTB2O95199 551 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF20P17024 532 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FSHRP23945 695 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK6Q00534 326 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC18A2Q05940 514 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 EFR3AQ14156 821 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKDD1AQ495B1 522 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 XKR5Q6UX68 686 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 VITQ6UXI7 678 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NXPE1Q8N323 547 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TMIEQ8NEW7 156 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC22A18Q96BI1 424 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF700Q9H0M5 742 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FXYD6Q9H0Q3 95 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC32A1Q9H598 525 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 USP29Q9HBJ7 922 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SIX2Q9NPC8 291 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 BRD7Q9NPI1 651 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ARL5AQ9Y689 179 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SAP18O00422 153 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ITM2AO43736 263 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 XPNPEP2O43895 674 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ECI2O75521 394 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB36O95755 333 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF3P17036 446 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 AOC1P19801 751 aa10.71□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FECHP22830 423 aa10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms