RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SLC6A6P31641 620 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC8A1P32418 973 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NR2C2P49116 596 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2J2P51589 502 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 F2RL1P55085 397 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PMPCAQ10713 525 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TCP10Q12799 353 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 STX3Q13277 289 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC39A6Q13433 755 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD40Q6AI12 368 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ASB18Q6ZVZ8 466 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HDDC2Q7Z4H3 204 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADCK2Q7Z695 626 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NRROSQ86YC3 692 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CPXM2Q8N436 756 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CLEC1AQ8NC01 280 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT10Q8NFP7 164 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LILRB4Q8NHJ6 448 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SOCS4Q8WXH5 440 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LPAR1Q92633 364 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SPSB1Q96BD6 273 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT11Q96G61 164 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC42Q96M95 316 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLITRK1Q96PX8 696 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TESK2Q96S53 571 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 HAUS8Q9BT25 410 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ADNPQ9H2P0 1102 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NGBQ9NPG2 151 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM74BQ9NUR3 256 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ASIC3Q9UHC3 531 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GUCA1BQ9UMX6 200 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GINS2Q9Y248 185 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ORC6Q9Y5N6 252 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CLIC4Q9Y696 253 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CEP290O15078 2479 aa2.42□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MYH4Q9Y623 1939 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RAD50Q92878 1312 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WZY1 265 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RNF222A6NCQ9 220 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LRRIQ4A6NIV6 560 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AHRRA9YTQ3 701 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPA7E9PJI5 369 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 FFAR3O14843 346 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ATP2A1O14983 1001 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 GPR42O15529 346 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ECE2O60344 883 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF217O75362 1048 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DCTN3O75935 186 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DDNO94850 711 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 UFL1O94874 794 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 AKR7A3O95154 331 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK5O95279 499 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OTCP00480 354 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CSF2P04141 144 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 NPIPA8P0DM63 369 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ITGALP20701 1170 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2A7P20853 494 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PSMB4P28070 264 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP1P28562 367 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 OR3A1P47881 315 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 MEOX1P50221 254 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TAS2R40P59535 323 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ARPC4P59998 168 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SNAP25P60880 206 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LSM3P62310 102 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PPP2R2BQ00005 443 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 CYTH1Q15438 398 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ASPHD1Q5U4P2 390 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ETFRF1Q6IPR1 90 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 PACS1Q6VY07 963 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 TAF8Q7Z7C8 310 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 RASAL3Q86YV0 1011 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf107Q8IVU9 208 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa2.41□□□□□ -2.02
CCSAP-202ENST00000366686 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa2.41□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms