RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF730Q6ZMV8 503 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TNS4Q8IZW8 715 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC58Q96CX6 371 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RCN3Q96D15 328 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CXCR6O00574 342 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM12O43184 909 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR10H3O60404 316 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 VTNP04004 478 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 JUPP14923 745 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RHCEP18577 417 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C17orf64Q86WR6 236 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FCAMRQ8WWV6 532 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CMTM7Q96FZ5 175 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C1orf74Q96LT6 269 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HSPA12BQ96MM6 686 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HSD17B14Q9BPX1 270 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DGCR6LQ9BY27 220 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 WDR26Q9H7D7 661 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TRPC4Q9UBN4 977 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KLF15Q9UIH9 416 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC6A5Q9Y345 797 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN24A6NM45 220 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAM170BA6NMN3 283 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ITM2AO43736 263 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC37A4O43826 429 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF10O60809 474 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BANF1O75531 89 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC10A3P09131 477 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC16A1P53985 500 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OGDHQ02218 1023 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ST3GAL3Q11203 375 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GPAT4Q86UL3 456 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C12orf40Q86WS4 652 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TICAM1Q8IUC6 712 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 PDZD9Q8IXQ8 264 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SVBPQ8N300 66 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ATG4AQ8WYN0 398 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA4DQ92854 862 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ARMC5Q96C12 935 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TSGA13Q96PP4 275 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SEPHS2Q99611 448 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HOXD1Q9GZZ0 328 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NT5MQ9NPB1 228 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OSGEPQ9NPF4 335 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 OR12D3Q9UGF7 316 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SLC7A8Q9UHI5 535 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CHKBQ9Y259 395 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TEX264Q9Y6I9 313 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC14BA6NHZ5 514 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GRM6O15303 877 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TPST1O60507 370 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NFATC1O95644 943 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 JCHAINP01591 159 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TRBC1P01850 177 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 BEX3Q00994 111 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 GRM2Q14416 872 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 DOK6Q6PKX4 331 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 C7orf61Q8IZ16 206 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CPT1BQ92523 772 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 COPS5Q92905 334 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL5Q96PQ7 755 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM175Q9BSA9 504 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TBC1D17Q9HA65 648 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TIGARQ9NQ88 270 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 NUP205Q92621 2012 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN4O14493 209 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 TREHO43280 583 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 ADAM23O75077 832 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 JRKO75564 520 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 SC5DO75845 299 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 EOMESO95936 686 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 USP17L7P0C7H9 530 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRD-201ENST00000355233 RAP2BP61225 183 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms