RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334186.8

PPFIA3-201, Transcript of PTPRF interacting protein alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPFIA3, Length 4,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3-201ENST00000334186 FRG2BQ96QU4 278 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 FUNDC2Q9BWH2 189 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SRRDQ9UH36 339 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 CLDN7O95471 211 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 CSF2P04141 144 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TJP1Q07157 1748 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 UPP1Q16831 310 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 GJD3Q8N144 294 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 COL21A1Q96P44 957 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 CLIC1O00299 241 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SLC25A12O75746 678 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ITGB1P05556 798 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 FPR1P21462 350 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PRR5P85299 388 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 MS4A2Q01362 244 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.161e-6■■■□□ 17.4
PPFIA3-201ENST00000334186 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 BORAQ6PGQ7 559 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ZFP3Q96NJ6 502 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 FCRL4Q96PJ5 515 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PTPN18Q99952 460 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TIGARQ9NQ88 270 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 RDH8Q9NYR8 311 aa16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 MID1O15344 667 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 MTX2O75431 263 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SAGP10523 405 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SLC9A3P48764 834 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TLE2Q04725 743 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PTPRCAPQ14761 206 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TMEM135Q86UB9 458 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 KCTD7Q96MP8 289 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 KCNK13Q9HB14 408 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 OSER1Q9NX31 292 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 MYH7P12883 1935 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SLITRK5O94991 958 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 MYF6P23409 242 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 GGT5P36269 586 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ZNF181Q2M3W8 571 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 UFD1Q92890 307 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 KCNN2Q9H2S1 579 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 H3BMQ9 156 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 STX16O14662 325 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 AOC2O75106 756 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 PLA2G16P53816 162 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 AMZ2Q86W34 360 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 KCNJ9Q92806 393 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 COG8Q96MW5 612 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 HTATIP2Q9BUP3 242 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TMEM27Q9HBJ8 222 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 AASSQ9UDR5 926 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 FBXW2Q9UKT8 454 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 KRBA1A5PL33 1030 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 CAPN14A8MX76 684 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 CD247P20963 164 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SLC5A2P31639 672 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TAF13Q15543 124 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SLC15A3Q8IY34 581 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 LCN9Q8WX39 176 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 MOCOSQ96EN8 888 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 SYT11Q9BT88 431 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.03■□□□□ 0.16
PPFIA3-201ENST00000334186 CALML5Q9NZT1 146 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms