RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 VAPAQ9P0L0 249 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 KCTD3Q9Y597 815 aa16.16■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 RECQL4O94761 1208 aa16.16■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 VTCN1Q7Z7D3 282 aa16.16■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.16■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 GALNT2Q10471 571 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 C11orf65Q8NCR3 313 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 UBE2FQ969M7 185 aa16.15■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 EP400Q96L91 3159 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ENGP17813 658 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 OR1E1P30953 314 aa16.15■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.15■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.15■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 LAX1Q8IWV1 398 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GPC2Q8N158 579 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 OR8K3Q8NH51 312 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ST8SIA2Q92186 375 aa16.15■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TRIB2Q92519 343 aa16.15■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 GADD45GO95257 159 aa16.15■□□□□ 0.18
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PACS1-201ENST00000320580 OR4F3Q6IEY1 312 aa16.14■□□□□ 0.17
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PACS1-201ENST00000320580 CCDC36Q8IYA8 594 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 EBPLQ9BY08 206 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 PLAC1Q9HBJ0 212 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SSX4O60224 188 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 UGT2B17O75795 530 aa16.14■□□□□ 0.17
PACS1-201ENST00000320580 SLC22A5O76082 557 aa16.14■□□□□ 0.17
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