RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD28O15084 1053 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR42O15529 346 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ULK1O75385 1050 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TIPRLO75663 272 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 WDR47O94967 919 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TGM1P22735 817 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 PIK3CGP48736 1102 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 C21orf59P57076 290 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 CDKL1Q00532 357 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 INPP5AQ14642 412 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TEAD4Q15561 434 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TTC23LQ6PF05 361 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 Q6ZSR6 202 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 DET1Q7L5Y6 550 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNEQ86WN2 208 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 KIAA2013Q8IYS2 634 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 DPP10Q8N608 796 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ASB12Q8WXK4 309 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 SCAMP4Q969E2 229 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 DTD2Q96FN9 168 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 GBP5Q96PP8 586 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ACTL8Q9H568 366 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ARL15Q9NXU5 204 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 KLQ9UEF7 1012 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TRPS1Q9UHF7 1281 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 PDE10AQ9Y233 779 aa15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 DNAH14Q0VDD8 3507 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 K7ESM1 405 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 PSMD11O00231 422 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 MANBAO00462 879 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ARPC2O15144 300 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 THEGLP0DJG4 465 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 BMP2P12643 396 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 IL10P22301 178 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 BNC1Q01954 994 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPA14Q0VDF9 509 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 CSRP2Q16527 193 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 SMU1Q2TAY7 513 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIM46Q7Z4K8 759 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 HID1Q8IV36 788 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKFN1Q8N957 763 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2I1PQ8NGU4 316 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM74Q96NL1 305 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC12A9Q9BXP2 914 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 MUC13Q9H3R2 512 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM83DQ9H4H8 585 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ALG2Q9H553 416 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC32A1Q9H598 525 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 CAPN10Q9HC96 672 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 OR1A2Q9Y585 309 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX11Q9Y5W9 270 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 AK5Q9Y6K8 562 aa15.34■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 DHRS12A0PJE2 317 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 LNP1A1A4G5 178 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TLR4O00206 839 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 AKAP10O43572 662 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 C8GP07360 202 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ENGP17813 658 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 JAK1P23458 1154 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 GGT5P36269 586 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 GBX1Q14549 363 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 AGERQ15109 404 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 NRF1Q16656 503 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 SGO1Q5FBB7 561 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 MTX3Q5HYI7 312 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 TBCELQ5QJ74 424 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 PRR23CQ6ZRP0 262 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ERMP1Q7Z2K6 904 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 DENND6BQ8NEG7 585 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ASB11Q8WXH4 323 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM192AQ9GZU8 254 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 PARVBQ9HBI1 364 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.33■□□□□ 0.05
TSNARE1-201ENST00000307180 GMEB1Q9Y692 573 aa15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms