RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 MANBAO00462 879 aa24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 GUCA1CO95843 209 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 FTH1P02794 183 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2ADP20671 130 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP2A7P20853 494 aa24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H2AJQ99878 128 aa24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 NANOGQ9H9S0 305 aa24.66■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 SH3GL1Q99961 368 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 LRTM1Q9HBL6 345 aa24.65■■□□□ 1.54
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