RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507		H0YGG7	62 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	DSCR3	O14972	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	VPS26A	O75436	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TSPAN12	O95859	305 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	IMPA1	P29218	277 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CMPK1	P30085	196 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ARSF	P54793	590 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	GRM7	Q14831	915 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ICE2	Q659A1	982 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	STEAP4	Q687X5	459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF425	Q6IV72	752 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	OLFM1	Q99784	485 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PSAT1	Q9Y617	370 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	HYKK	A2RU49	373 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ZBTB14	O43829	449 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PIAS1	O75925	651 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	FOLR3	P41439	243 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	KLRB1	Q12918	225 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	NKG7	Q16617	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PHKG1	Q16816	387 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TCTE1	Q5JU00	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PLD3	Q8IV08	490 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SHISA5	Q8N114	240 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PTER	Q96BW5	349 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	C10orf90	Q96M02	699 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	OR2A5	Q96R48	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SPSB2	Q99619	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	NAT9	Q9BTE0	207 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	CTSF	Q9UBX1	484 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
EDC4-210	ENST00000575507	ESYT3	A0FGR9	886 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507		E7ESA3	106 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507		H7BY64	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	HSD17B2	P37059	387 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	CSRP3	P50461	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	PLTP	P55058	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	MLLT10	P55197	1068 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	ARL4C	P56559	192 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	KCNC4	Q03721	635 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	CBLB	Q13191	982 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	RAPSN	Q13702	412 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	HIF1A	Q16665	826 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	HKDC1	Q2TB90	917 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	MED25	Q71SY5	747 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	TEX19	Q8NA77	164 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EDC4-210	ENST00000575507	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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