RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 GPR85P60893 370 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 BECN1Q14457 450 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 KIR2DS3Q14952 304 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 EXT1Q16394 746 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 MUM1Q2TAK8 710 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 C6orf52Q5T4I8 152 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 LIPNQ5VXI9 398 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 DNAJC24Q6P3W2 148 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 LIX1Q8N485 282 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 OR5AR1Q8NGP9 310 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TRIB3Q96RU7 358 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 LPAR3Q9UBY5 353 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 AMACRQ9UHK6 382 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ACAD8Q9UKU7 415 aa11.7□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 H3BRJ5 948 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CASKO14936 926 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SLC16A5O15375 505 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SGTAO43765 313 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TPBGLP0DKB5 382 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TPH1P17752 444 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 PDHA2P29803 388 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ARL4AP40617 200 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 PPIAP62937 165 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CCDC38Q502W7 563 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SEM1Q6ZVN7 128 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 AMER3Q8N944 861 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 DTX3LQ8TDB6 740 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 C10orf90Q96M02 699 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 GSDMAQ96QA5 445 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 COG4Q9H9E3 785 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CDC14AQ9UNH5 594 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 LIPGQ9Y5X9 500 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 VWFP04275 2813 aa11.69□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 FAM166BA8MTA8 275 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 MATN3O15232 486 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.544e-9■■■□□ 17.9
NOP56-204ENST00000460258 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CALB1P05937 261 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SERPINB6P35237 376 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SLC26A3P40879 764 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 NSFP46459 744 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 HLCSP50747 726 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 FMO1Q01740 532 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ITGA9Q13797 1035 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SYT16Q17RD7 645 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 WLSQ5T9L3 541 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 FRMPD2BQ6IN97 320 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ZNF677Q86XU0 584 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 LRRC49Q8IUZ0 686 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ISL2Q96A47 359 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 KCNK17Q96T54 332 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CYTH2Q99418 400 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 VN1R1Q9GZP7 353 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SHARPINQ9H0F6 387 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CFAP45Q9UL16 551 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CTSVO60911 334 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 GABRA1P14867 456 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CHRNB2P17787 502 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 HMGCLP35914 325 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 RBMXP38159 391 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CDR2Q01850 454 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TRIM14Q14142 442 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TRILQ7L0X0 811 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 NELFBQ8WX92 580 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 CABS1Q96KC9 395 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 SMOXQ9NWM0 555 aa11.67□□□□□ -0.54
NOP56-204ENST00000460258 TMEM160Q9NX00 188 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms