RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438120.5

PTPRF-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRF, Length 6,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-209ENST00000438120 SPATA7Q9P0W8 599 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 A0A1W2PQY0 241 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 UPK3BL1B0FP48 263 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 UPK3BL2E5RIL1 263 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 LINGO3P0C6S8 592 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 TYRP1P17643 537 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PDX1P52945 283 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ADNP2Q6IQ32 1131 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PROKR2Q8NFJ6 384 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CST11Q9H112 138 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 TLR9Q9NR96 1032 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 P2RX2Q9UBL9 471 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 FABP12A6NFH5 140 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 FAM159BA6NKW6 160 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 FGF18O76093 207 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 LMX1AQ8TE12 382 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 FZD9O00144 591 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PRAMEF10O60809 474 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 HSD17B2P37059 387 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 BPIFB1Q8TDL5 484 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 MGME1Q9BQP7 344 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 GDAP2Q9NXN4 497 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CYB5AP00167 134 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 GHRHRQ02643 423 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ENPP2Q13822 863 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 SMYD5Q6GMV2 418 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 EURLQ9NYK6 297 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 DUXAA6NLW8 204 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 HOXB2P14652 356 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 MAPK14Q16539 360 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 USP29Q9HBJ7 922 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 MTMR11A4FU01 709 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 KLHL22Q53GT1 634 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 GIN1Q9NXP7 522 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 LEFTY2O00292 366 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CDH1P12830 882 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 GLOD5A6NK44 160 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF726A6NNF4 738 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 H3BNX3 289 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CLPXO76031 633 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CD2P06729 351 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 HCAR3P49019 387 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 TIGD6Q17RP2 521 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 SQORQ9Y6N5 450 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 TRBC2A0A5B9 178 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 TNFRSF10BO14763 440 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRF-209ENST00000438120 KDELR3O43731 214 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 NUDT6P53370 316 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ODF4Q2M2E3 257 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 SPIN4Q56A73 249 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 LY6G5CQ5SRR4 150 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 FETUBQ9UGM5 382 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 CHRNA1P02708 482 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 SPATC1Q76KD6 591 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRF-209ENST00000438120 NCSTNQ92542 709 aa16.73■□□□□ 0.27
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