RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 MED16Q9Y2X0 877 aa14.83□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SCN2AQ99250 2005 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.82□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 SLC16A8O95907 504 aa14.82□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 HKDC1Q2TB90 917 aa14.82□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 ICE2Q659A1 982 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 PAQR7Q86WK9 346 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZNF480Q8WV37 535 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 TM9SF4Q92544 642 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 C8orf44Q96CB5 159 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 FLNCQ14315 2725 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SMAPO00193 183 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 MAP2K7O14733 419 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 KLHL41O60662 606 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 BANF1O75531 89 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 CCNDBP1O95273 360 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SOX8P57073 446 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.81□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 OR11G2Q8NGC1 345 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 CD200R1Q8TD46 325 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SSC4DQ8WTU2 575 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 CNDP1Q96KN2 507 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 OSBPL9Q96SU4 736 aa14.81□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 C3orf18Q9UK00 162 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.81□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 MAGEB16A2A368 324 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZNF839A8K0R7 811 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 HAT1O14929 419 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 P2RX6O15547 441 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 HAUS5O94927 633 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 MPC1LP0DKB6 136 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 MAGEA3P43357 314 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 Q0VFX4 171 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.8□□□□□ -0.04
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ACTB-202ENST00000414620 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZNF425Q6IV72 752 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 KCNMB4Q86W47 210 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.047e-10■■■□□ 17.8
ACTB-202ENST00000414620 GRK7Q8WTQ7 553 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 KCNJ9Q92806 393 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 AGAP4Q96P64 663 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 LHPPQ9H008 270 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-202ENST00000414620 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.8□□□□□ -0.04
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