RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TESCQ96BS2 214 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HHIPQ96QV1 700 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RMND5AQ9H871 391 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 BRD9Q9H8M2 597 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PPT2Q9UMR5 302 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX6Q9UNH7 406 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LEFTY1O75610 366 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GSNP06396 782 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HTR1AP08908 422 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NEK2P51955 445 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM9CQ8IZT9 166 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CSF3RQ99062 836 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PALMDQ9NP74 551 aa18.21■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 WNT9AO14904 365 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SDC1P18827 310 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PRKACGP22612 351 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKN2CP42773 168 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A12P48065 614 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC6A11P48066 632 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 GABARAPL2P60520 117 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CD47Q08722 323 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF77Q15935 545 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD46Q86W74 232 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 L3MBTL4Q8NA19 623 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ASB11Q8WXH4 323 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CMTM7Q96FZ5 175 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PYURFQ96I23 114 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGED4Q96JG8 741 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TSSK3Q96PN8 268 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOVL6Q9H5J4 265 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A13Q9UJS0 675 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf18Q9UK00 162 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPB8E9PQR5 432 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL10O95999 233 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 B3GALT4O96024 378 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 C8GP07360 202 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ISL1P61371 349 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ABHD18Q0P651 414 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 FRS2Q8WU20 508 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 HS3ST2Q9Y278 367 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ALPK3Q96L96 1907 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 HS6ST1O60243 411 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CTSLP07711 333 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 MAPK10P53779 464 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G16P53816 162 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CARD16Q5EG05 197 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PRSS36Q5K4E3 855 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NEK5Q6P3R8 708 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DCDC5Q6ZRR9 648 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZVL8 140 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXJ1Q92949 421 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa18.2■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NUAK1O60285 661 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 OR56A5P0C7T3 313 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 VAC14Q08AM6 782 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPA14Q0VDF9 509 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PTCHD3Q3KNS1 767 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CES5AQ6NT32 575 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 USP45Q70EL2 814 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 HERVK_113Q902F9 699 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NXPE3Q969Y0 559 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 FKBP10Q96AY3 582 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 APIPQ96GX9 242 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TMED5Q9Y3A6 229 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0C4DFX4 3053 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 KNL1Q8NG31 2342 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC16A6O15403 523 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF4O60810 478 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 E2F6O75461 281 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PCSK2P16519 638 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 ETV3P41162 512 aa18.19■□□□□ 0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEA2P43356 314 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms