RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 OR1G1P47890 313 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 RGS6P49758 472 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 LIMK1P53667 647 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 PRKCZQ05513 592 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 ARTNQ5T4W7 220 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 PIK3R6Q5UE93 754 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 MANEALQ5VSG8 457 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 PAF1Q8N7H5 531 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 UBASH3BQ8TF42 649 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 B3GALT6Q96L58 329 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 SYTL2Q9HCH5 934 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa16.34■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 RHOBTB1O94844 696 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 PTHP01270 115 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 VIPP01282 170 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 CAPN1P07384 714 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 HMBSP08397 361 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 PRSS56P0CW18 603 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 ADORA3P0DMS8 318 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 DAB2P98082 770 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 DERL2Q9GZP9 239 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 C12orf10Q9HB07 376 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 ATP13A1Q9HD20 1204 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 NT5MQ9NPB1 228 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 C1orf109Q9NX04 203 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 CFL2Q9Y281 166 aa16.33■□□□□ 0.21
GDE1-201ENST00000353258 A0A1W2PQ09 198 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 J3KR12 359 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 IL12RB1P42701 662 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 NUDT6P53370 316 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FAPQ12884 760 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 NPRL3Q12980 569 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FAM171A1Q5VUB5 890 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FLCNQ8NFG4 579 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 METTL6Q8TCB7 284 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB18Q99592 522 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 PITX2Q99697 317 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.33■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 STX16O14662 325 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FPR1P21462 350 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 CAP1Q01518 475 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 IHHQ14623 411 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 MIB1Q86YT6 1006 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 BBS2Q9BXC9 721 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 UCK2Q9BZX2 261 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 PER2O15055 1255 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 LDB2O43679 373 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 CDK1P06493 297 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 EFEMP1Q12805 493 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 ALFQ53S48 1182 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 GPR153Q6NV75 609 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 DEDD2Q8WXF8 326 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 MYDGFQ969H8 173 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FKBP14Q9NWM8 211 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 GPR83Q9NYM4 423 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 V9GYH0 126 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 A0A0B4J293 547 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 E2F3O00716 465 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 SHOXO15266 292 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 STSP08842 583 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 PRIM2P49643 509 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 GPR151Q8TDV0 419 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 GGHQ92820 318 aa16.32■□□□□ 0.2
GDE1-201ENST00000353258 RNF31Q96EP0 1072 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68 ms