RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 SFTPCP11686 197 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARSFP54793 590 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R39P59534 338 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPX6P59796 221 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABATP80404 500 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF460Q14592 562 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASHC2DQ5SRD0 308 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO42Q6P3S6 717 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTLL10Q6ZVT0 673 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHRS4Q9BTZ2 278 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A11Q9NSA0 550 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBD1Q9UJT1 453 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM159BA6NKW6 160 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSCR3O14972 297 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED26O95402 600 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTA2P09210 222 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAT1P21673 171 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMS2P54278 862 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGTRAPQ6RW13 159 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC25Q86WR0 208 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 THAP4Q8WY91 577 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED13Q9UHV7 2174 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 H0YGG7 62 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ONECUT2O95948 504 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 EZRP15311 586 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALAS2P22557 587 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEA4P43358 317 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFATC3Q12968 1075 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MLIPQ5VWP3 458 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPZQ66K79 652 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBSNQ6UWP8 590 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYS1Q717R9 158 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX15Q7KZN9 410 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP97Q8IW35 865 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTWD1Q8N5C7 304 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKL2Q92772 493 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A18Q9H1K4 315 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HYKKA2RU49 373 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAT1O14929 419 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFPL1O75677 317 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2ADP20671 130 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 AP1S2P56377 157 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXL2P58012 376 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 RELAQ04206 551 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R3AQ16821 1122 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRTGQ2VWP7 1150 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADCK2Q7Z695 626 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM151BQ8IW70 566 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMGT1Q8N4V1 131 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 FKBP10Q96AY3 582 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 C10orf90Q96M02 699 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2A5Q96R48 311 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBBP8Q99708 897 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPNE1Q99829 537 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H2AJQ99878 128 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 H2AFJQ9BTM1 129 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGPP1Q9BX95 441 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 POPDC3Q9HBV1 291 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARL15Q9NXU5 204 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARGFXA6NJG6 315 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 B8ZZF3 427 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 H7BY64 318 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms