RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ARL15Q9NXU5 204 aa16.19■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GNB5O14775 395 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 KPNA5O15131 536 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 AKR7A2O43488 359 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 BMP1P13497 986 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TOR2AQ5JU69 321 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TMEM130Q8N3G9 435 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CD93Q9NPY3 652 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 H3BM21 787 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 MPZL2O60487 215 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A4P31645 630 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ISL1P61371 349 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GTF2H2Q13888 395 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ZNF789Q5FWF6 425 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 IDNKQ5T6J7 187 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SWI5Q1ZZU3 235 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TM9SF2Q99805 663 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 HDHD5Q9BXW7 423 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.18■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 UBE2QL1A1L167 161 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GSAPA4D1B5 854 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 KERAO60938 352 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SSTR2P30874 369 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 STAT5AP42229 794 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RGS6P49758 472 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CASP9P55211 416 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 KCNA10Q16322 511 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 WSCD1Q658N2 575 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RAD18Q9NS91 495 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SARDHQ9UL12 918 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CLCA1A8K7I4 914 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ZNF487B1APH4 448 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RPP40O75818 363 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 LCN1P31025 176 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ETV1P50549 477 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 C2orf80Q0P641 193 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RCAN2Q14206 197 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 KLHL6Q8WZ60 621 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SCRN2Q96FV2 425 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 MRIQ9BWK5 157 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 NUDT1P36639 197 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 PSMD8P48556 350 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 JAG1P78504 1218 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ABHD18Q0P651 414 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 C22orf42Q6IC83 251 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 RIPK3Q9Y572 518 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 PAPPAQ13219 1627 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SLC12A8A0AV02 714 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CLIC1O00299 241 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GPR182O15218 404 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 CXCR4P61073 352 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GTDC1Q4AE62 458 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 OR4K2Q8NGD2 314 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SGTBQ96EQ0 304 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.17■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 MATN3O15232 486 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 HCRTO43612 131 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 ACSL4O60488 711 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 STX11O75558 287 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 LMO2P25791 158 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 BCL2L15Q5TBC7 163 aa16.16■□□□□ 0.18
PACS1-201ENST00000320580 TRNP1Q6NT89 227 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms