RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q3UY34 256 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pdcd4Q61823 469 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brinp2Q6DFY8 783 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr798Q7TRH8 311 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr297Q7TS07 310 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SvopQ8BFT9 548 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc73Q8JZM7 531 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r24Q8R2D6 296 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr315Q8VFG7 309 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhrs7bQ99J47 323 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp773Q9CZ29 471 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdh17Q9R100 827 aa12.5□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spta1P08032 2415 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ItpkbB2RXC2 942 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Phf11cB4XVP9 339 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr891E9Q843 316 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FgrP14234 517 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp3cbP48453 525 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf215Q5SPX3 379 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tas2r106Q7M724 308 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cars2Q8BYM8 551 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sdr9c7Q8K3P0 313 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Grip1Q925T6 1127 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PglsQ9CQ60 257 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufs4Q9CXZ1 175 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D112 206 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnase1l2Q9D1G0 278 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myh10Q61879 1976 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wscd2D4PHA7 571 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr137cE9Q343 423 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 JhyE9Q793 770 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr618K7N6B3 318 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrp2O35375 931 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ech1O35459 327 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl5P47962 297 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mks1Q5SW45 561 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpina3aQ6P4P1 422 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiss1Q6Y4S4 130 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam92aQ8BP22 355 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il17rdQ8JZL1 738 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr808Q8VGI8 312 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chid1Q922Q9 393 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PrkxQ922R0 355 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clcc1Q99LI2 539 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RtcAQ9D7H3 366 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrp5Q91VN0 1614 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10477F6SW83 55 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2610028H24RikG5E8K1 270 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PfklP12382 780 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esr1P19785 599 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rps3P62908 243 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Shox2P70390 331 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec24aQ3U2P1 1090 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim40Q3UWA4 246 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FaddQ61160 205 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Reps2Q80XA6 521 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fjx1Q8BQB4 450 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc34Q8C0Q3 554 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Olfr53Q8VGL8 312 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Paip2bQ91W45 136 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dtwd1Q9D8U7 304 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnaja4Q9JMC3 397 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc7a9Q9QXA6 487 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssxa1B1AUS7 101 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7945F6QI24 236 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm28048F7BCN0 99 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 March5Q3KNM2 278 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znrf3Q5SSZ7 913 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pced1bQ8BGX1 433 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 C5ar2Q8BW93 344 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MrgpreQ91ZB7 310 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ak5Q920P5 562 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arl4dQ99PE9 201 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ern1Q9EQY0 977 aa12.49□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Esp31A8R0W3 114 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Daw1D3Z7A5 415 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp395E9Q5N9 508 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13128L7MU96 475 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10324L7N208 604 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Csnk2a2O54833 350 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chst3O88199 472 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sbk3P0C5K0 361 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sec31bQ3TZ89 1158 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif18bQ6PFD6 834 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap19Q8BRH3 494 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Colec10Q8CF98 277 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spin4Q8K1L2 249 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gprc6aQ8K4Z6 928 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Isl2Q9CXV0 359 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp2a22B2RXZ2 492 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hipk1O88904 1210 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp60P16374 707 aa12.48□□□□□ -0.41
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hexim2Q3TVI4 313 aa12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.5 ms