RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 POLE4Q9NR33 117 aa14.66□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 FKBP14Q9NWM8 211 aa14.66□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.66□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 COL4A6Q14031 1691 aa14.66□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 H3BMQ9 156 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 STK16O75716 305 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 EPORP19235 508 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 TPGS2Q68CL5 300 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 COG8Q96MW5 612 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 ZNF583Q96ND8 569 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 COPS8Q99627 209 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 NRTNQ99748 197 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 LRRC3Q9BY71 257 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 ACPTQ9BZG2 426 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 AQP12BA6NM10 295 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 MAN1A2O60476 641 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 FGF18O76093 207 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTIF-205ENST00000587860 PRKCAP17252 672 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 SLC14A1Q13336 389 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 STK11Q15831 433 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTIF-205ENST00000587860 AQP12AQ8IXF9 295 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 TMBIM1Q969X1 311 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 MUS81Q96NY9 551 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 MYOCQ99972 504 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 INVSQ9Y283 1065 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 CCL27Q9Y4X3 112 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 A0A0C4DFX4 3053 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 VPS4BO75351 444 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 CXCL10P02778 98 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 GBAP04062 536 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 EMX2Q04743 252 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.067e-8■■■■□ 23.2
CTIF-205ENST00000587860 TCEAL8Q8IYN2 117 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 APIPQ96GX9 242 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 TRIM15Q9C019 465 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 NTN4Q9HB63 628 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CTIF-205ENST00000587860 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa14.65□□□□□ -0.06
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CTIF-205ENST00000587860 H3BUI4 141 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MANBAO00462 879 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTIF-205ENST00000587860 PGRP06401 933 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 BCKDHAP12694 445 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 BMPR1AP36894 532 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HSPA13P48723 471 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTIF-205ENST00000587860 BNIP2Q12982 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 TEAD2Q15562 447 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM215Q68D42 235 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTIF-205ENST00000587860 OR2T12Q8NG77 320 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTIF-205ENST00000587860 MTHFRP42898 656 aa14.64□□□□□ -0.07
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CTIF-205ENST00000587860 OXA1LQ15070 435 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 CDONQ4KMG0 1287 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 ADNPQ9H2P0 1102 aa14.64□□□□□ -0.07
CTIF-205ENST00000587860 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.64□□□□□ -0.07
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