RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 ASB12Q8WXK4 309 aa20.85■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRM-211ENST00000580170 VLDLRP98155 873 aa20.82■□□□□ 0.92
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