RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 SERPINB12Q96P63 405 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 PKP4Q99569 1192 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 DPH7Q9BTV6 452 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 ACAT2Q9BWD1 397 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 SLC6A20Q9NP91 592 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 SAMD15Q9P1V8 674 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 MED16Q9Y2X0 877 aa13.84□□□□□ -0.19
CS-229ENST00000551936 CTAGE9A4FU28 777 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 GOLGA8MH3BSY2 632 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 USP1O94782 785 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 MAGEA3P43357 314 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 CYHR1Q6ZMK1 362 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 REXO1L1PQ8IX06 675 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 GIMAP7Q8NHV1 300 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SMPDL3AQ92484 453 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PLCD4Q9BRC7 762 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ZNF304Q9HCX3 659 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 KLHL42Q9P2K6 505 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 CTSFQ9UBX1 484 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 CDC23Q9UJX2 597 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 FAM169AQ9Y6X4 670 aa13.83□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 HECTD1Q9ULT8 2610 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 BLACEA4D250 179 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 TCP11X1B4DZS4 312 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 NRDCO43847 1150 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 CATP04040 527 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 MPC1LP0DKB6 136 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 GP1BBP13224 206 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 VARSP26640 1264 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PNLIPRP1P54315 467 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ARHGAP19Q14CB8 494 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 NAA25Q14CX7 972 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PRTGQ2VWP7 1150 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 CRB2Q5IJ48 1285 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 FHL5Q5TD97 284 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 KIRREL2Q6UWL6 708 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PAQR7Q86WK9 346 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 INPP5DQ92835 1189 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 C19orf60Q96EN9 201 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 C10orf90Q96M02 699 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SYNPO2LQ9H987 977 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 FAM114A2Q9NRY5 505 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SEMA3GQ9NS98 782 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 FBXL4Q9UKA2 621 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 DHRS7Q9Y394 339 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 DOCK10Q96BY6 2186 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 FLNCQ14315 2725 aa13.82□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 E7ENX8 843 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 H0YGG7 62 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 GFYI3L273 518 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 KIF5CO60282 957 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ALOX12BO75342 701 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 HAUS5O94927 633 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SLC16A8O95907 504 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ALPPP05187 535 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ITGA3P26006 1051 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 HSD17B2P37059 387 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SLC1A2P43004 574 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 EMP3P54852 163 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 TAP2Q03519 686 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 CUL1Q13616 776 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 LONRF1Q17RB8 773 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 TTLL9Q3SXZ7 439 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 Q6ZS92 163 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 LMNTD2Q8IXW0 634 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 SLC35F6Q8N357 371 aa13.81□□□□□ -0.2
CS-229ENST00000551936 PPFIBP2Q8ND30 876 aa13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms