RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550808.5

MTA1-218, Transcript of metastasis associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTA1, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1-218ENST00000550808 SPSB2Q99619 263 aa22.13■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 DPH7Q9BTV6 452 aa22.13■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.13■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.13■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 FITM1A5D6W6 292 aa22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ONECUT2O95948 504 aa22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CMPK1P30085 196 aa22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ADARP55265 1226 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 KLK4Q9Y5K2 254 aa22.12■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CTAGE9A4FU28 777 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SOCS6O14544 535 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 USP1O94782 785 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 RNF44Q7L0R7 432 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 DENND6AQ8IWF6 608 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 IQCKQ8N0W5 287 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SLC30A3Q99726 388 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa22.11■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 OR2A25A4D2G3 310 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 NRDCO43847 1150 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 KLHL41O60662 606 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SEMA7AO75326 666 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CATP04040 527 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ERVK-10P10266 1014 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CLCN7P51798 805 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SOX8P57073 446 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CTBP1Q13363 440 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 RBBP7Q16576 425 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 IGFL3Q6UXB1 125 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SMPDL3AQ92484 453 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 TM9SF4Q92544 642 aa22.1■■□□□ 1.13
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MTA1-218ENST00000550808 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.1■■□□□ 1.13
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MTA1-218ENST00000550808 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.1■■□□□ 1.13
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MTA1-218ENST00000550808 ENAMQ9NRM1 1142 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ABCF3Q9NUQ8 709 aa22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 MYO1CO00159 1063 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ERGP11308 486 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 MLNP12872 115 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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MTA1-218ENST00000550808 CUL1Q13616 776 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 GIMAP7Q8NHV1 300 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 INPP5DQ92835 1189 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 NACC2Q96BF6 587 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 PBKQ96KB5 322 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 SERPINB12Q96P63 405 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 MESP1Q9BRJ9 268 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ASF1BQ9NVP2 202 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.09■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 MAGEB16A2A368 324 aa22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 H0YGG7 62 aa22.08■■□□□ 1.13
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MTA1-218ENST00000550808 PNLIPRP1P54315 467 aa22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 NAA25Q14CX7 972 aa22.08■■□□□ 1.13
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MTA1-218ENST00000550808 ARMC3Q5W041 872 aa22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 MCUQ8NE86 351 aa22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 PRR7Q8TB68 274 aa22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CABS1Q96KC9 395 aa22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 C10orf90Q96M02 699 aa22.08■■□□□ 1.13
MTA1-218ENST00000550808 CRB3Q9BUF7 120 aa22.08■■□□□ 1.13
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