RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EDNRAP25101 427 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBMXP38159 391 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MATKP42679 507 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SRPXP78539 464 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCGF3Q3KNV8 242 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM198Q66K66 360 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF547Q8IVP9 402 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AFAP1Q8N556 730 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MOSPD2Q8NHP6 518 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIAA1524Q8TCG1 905 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC107Q8WV48 283 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMARCE1Q969G3 411 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 B3GAT1Q9P2W7 334 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBX20Q9UMR3 447 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SELENOKQ9Y6D0 94 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COL1A2P08123 1366 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 QDPRP09417 244 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD1EP15812 388 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACHEP22303 614 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAFAH1B1P43034 410 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCR3P51677 355 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARSEP51690 589 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC63Q05C16 580 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ISXQ2M1V0 245 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF506Q5JVG8 444 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELFN2Q5R3F8 820 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM69AQ5T7M9 428 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACSM2BQ68CK6 577 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CGB2Q6NT52 195 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUDT13Q86X67 352 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARHGAP24Q8N264 748 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMTC2Q8N394 836 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5M8Q8NGP6 311 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GTSF1Q8WW33 167 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELSPBP1Q96BH3 223 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C4orf45Q96LM5 186 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RANBP9Q96S59 729 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MARCH7Q9H992 704 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OSER1Q9NX31 292 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NLGN3Q9NZ94 848 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TENM1Q9UKZ4 2725 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SSX4O60224 188 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KBTBD11O94819 623 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PARNO95453 639 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ICAM3P32942 547 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GRK6P43250 576 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RIDAP52758 137 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GALCP54803 685 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NAAAQ02083 359 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NHLRC3Q5JS37 347 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBQLNLQ8IYU4 475 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM116Q8NCL8 245 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHURC1Q8WUH1 139 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C11orf52Q96A22 123 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP1R16AQ96I34 528 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR6C1Q96RD1 312 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCGF6Q9BYE7 350 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MTMR12Q9C0I1 747 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPV4Q9HBA0 871 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 K7EQG2 157 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FPGTO14772 594 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TGFB1I1O43294 461 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DFNA5O60443 496 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF253O75346 499 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STAM2O75886 525 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ACSL3O95573 720 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 APBB3O95704 486 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GP1BBP13224 206 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PKLRP30613 574 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYL7Q01449 175 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SGCGQ13326 291 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EMBQ6PCB8 327 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPAINQ86UA6 219 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CEP57L1Q8IYX8 460 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR4D10Q8NGI6 311 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AFAP1L1Q8TED9 768 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC22A18Q96BI1 424 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TAAR6Q96RI8 345 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMC4Q9NTJ3 1288 aa0.87□□□□□ -2.27
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms