RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 MYBPC3Q14896 1274 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 NEK10Q6ZWH5 1172 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 GALNT16Q8N428 558 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 RAB42Q8N4Z0 105 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 DPH7Q9BTV6 452 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 C5AR2Q9P296 337 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL42Q9P2K6 505 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 A0A0J9YVX5 310 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 VSTM2BA6NLU5 285 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 AGPSO00116 658 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SOCS6O14544 535 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 NRDCO43847 1150 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 MMP11P24347 488 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 OR1D4P47884 311 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGAP19Q14CB8 494 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 SUSD1Q6UWL2 747 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 CYHR1Q6ZMK1 362 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ATCAYQ86WG3 371 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ9Q92806 393 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 NACC2Q96BF6 587 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 C10orf90Q96M02 699 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 PKP4Q99569 1192 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ACAT2Q9BWD1 397 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 MFRPQ9BY79 579 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 LUZP4Q9P127 313 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXB3-211ENST00000490677 ICE1Q9Y2F5 2266 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 HYKKA2RU49 373 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PEX12O00623 359 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 FNTAP49354 379 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CUL1Q13616 776 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PRTGQ2VWP7 1150 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 IGFL3Q6UXB1 125 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 GALNT11Q8NCW6 608 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PNPLA2Q96AD5 504 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 E5RI56 91 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 GFYI3L273 518 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SLC16A8O95907 504 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 MPP1Q00013 466 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF425Q6IV72 752 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PAQR7Q86WK9 346 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 FAM26EQ8N5C1 309 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CLEC1AQ8NC01 280 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CD200R1Q8TD46 325 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF480Q8WV37 535 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ASB11Q8WXH4 323 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SMPDL3AQ92484 453 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PLCD4Q9BRC7 762 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 MESP1Q9BRJ9 268 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SNX12Q9UMY4 172 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 DHRS7Q9Y394 339 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 FAM169AQ9Y6X4 670 aa26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CTAGE9A4FU28 777 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CES2O00748 559 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 IGHEP01854 428 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CATP04040 527 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 GNLYP22749 145 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 CMPK1P30085 196 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 LONRF1Q17RB8 773 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 FAM214AQ32MH5 1076 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 KIRREL2Q6UWL6 708 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 GPR21Q99679 349 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 FAM114A2Q9NRY5 505 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 FBXL4Q9UKA2 621 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 FBXO5Q9UKT4 447 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 MAU2Q9Y6X3 613 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 E7ENX8 843 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 H0YGG7 62 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ALOX12BO75342 701 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 HAUS5O94927 633 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 MPC1LP0DKB6 136 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PNLIPRP1P54315 467 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 TAP2Q03519 686 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 LMNTD2Q8IXW0 634 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXB3-211ENST00000490677 PPIL6Q8IXY8 311 aa26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms