RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 MTX2O75431 263 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 MTA2O94776 668 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KIAA0754O94854 1291 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CDK14O94921 469 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NDST3O95803 873 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 VIPP01282 170 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 EPOP01588 193 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 H2AFZP0C0S5 128 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PIRTP0C851 137 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TYRP1P17643 537 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CA5AP35218 305 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 HMGCLP35914 325 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KIR2DL3P43628 341 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPZBP47756 277 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GYS2P54840 703 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ADAM8P78325 824 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 DMPKQ09013 629 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KLRB1Q12918 225 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR18Q14330 331 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT3Q14435 633 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PDK1Q15118 436 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TERF2Q15554 542 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC18A3Q16572 532 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TAZQ16635 292 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TEX44Q53QW1 395 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC38Q5VT99 294 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ALS2CLQ60I27 953 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 H2AFVQ71UI9 128 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 LUZP1Q86V48 1076 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TTC30BQ8N4P2 665 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CDYL2Q8N8U2 506 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IL17DQ8TAD2 202 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 RSC1A1Q92681 617 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TEKT5Q96M29 485 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TGM7Q96PF1 710 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 OR6C1Q96RD1 312 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SOX7Q9BT81 388 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GLOD4Q9HC38 313 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 EMC7Q9NPA0 242 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IL26Q9NPH9 171 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 POT1Q9NUX5 634 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IL17CQ9P0M4 197 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KCND3Q9UK17 655 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PADI1Q9ULC6 663 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF711Q9Y462 761 aa6.21□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CENPEQ02224 2701 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 C21orf140B9A014 251 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CREG1O75629 220 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFA10O95299 355 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GP1BBP13224 206 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 FOLR1P15328 257 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 AMD1P17707 334 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 IDSP22304 550 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPN3P26045 913 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CASP14P31944 242 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 GJC1P36383 396 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 DLSTP36957 453 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ARHGAP25P42331 645 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 MAPK9P45984 424 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1CAP62136 330 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 FOXM1Q08050 763 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 AP1B1Q10567 949 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 WASHC5Q12768 1159 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SEMA5AQ13591 1074 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ERV3-1Q14264 604 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 RPE65Q16518 533 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 METRNLQ641Q3 311 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 KDELC1Q6UW63 502 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 NPNTQ6UXI9 565 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM135Q86UB9 458 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms