RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ATP6V1B2P21281 511 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA13P48723 471 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC7A2P52569 658 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CTSCP53634 463 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ADARP55265 1226 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DS5Q14953 304 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CYP2R1Q6VVX0 501 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ACVR1CQ8NER5 493 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FBXL8Q96CD0 374 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 VPS35Q96QK1 796 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NPAS2Q99743 824 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 BRINP2Q9C0B6 783 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PDE10AQ9Y233 779 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TBX10O75333 385 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NT5EP21589 574 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A2P23975 617 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRR5P85299 388 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OR4D1Q15615 310 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 WSCD2Q2TBF2 565 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GPAT3Q53EU6 434 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDK20Q8IZL9 346 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C10orf53Q8N6V4 93 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS15Q8TE58 950 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RNF145Q96MT1 663 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF607Q96SK3 696 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC3Q9BY71 257 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FAM234BA2RU67 622 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ALBP02768 609 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HSD3B1P14060 373 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HSD3B2P26439 372 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GALNT4Q8N4A0 578 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 EBF4Q9BQW3 602 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RDH14Q9HBH5 336 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 WNT16Q9UBV4 365 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM233B4DJY2 109 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LDLRP01130 860 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 AGXTP21549 392 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 AOAHP28039 575 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NEK2P51955 445 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PGGT1BP53609 377 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MPP2Q14168 576 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 UNC50Q53HI1 259 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF683Q8IZ20 524 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C10orf82Q8WW14 230 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ROPN1LQ96C74 230 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PPM1MQ96MI6 270 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 IL17FQ96PD4 163 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 DUSP26Q9BV47 211 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PHF11Q9UIL8 331 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PDPK1O15530 556 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GPR39O43194 453 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LATO43561 262 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC16A8O95907 504 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CCR7P32248 378 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 VHLP40337 213 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 COPZ1P61923 177 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC13A2Q13183 592 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MED21Q13503 144 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PAOXQ6QHF9 649 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 Q7L0L9 218 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FITM2Q8N6M3 262 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR2T12Q8NG77 320 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 A8MU76 341 aa8.02□□□□□ -1.13
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