RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 VWA7Q9Y334 891 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa22.99■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 E7ENX8 843 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 C8GP07360 202 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ALAS2P22557 587 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ARSFP54793 590 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 NFKB2Q00653 900 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 TAP2Q03519 686 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 MLIPQ5VWP3 458 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 FAM45BPQ6NSW5 357 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 CAPN12Q6ZSI9 719 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF605Q86T29 641 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 FAM45AQ8TCE6 357 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 RAB17Q9H0T7 212 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 STARD5Q9NSY2 213 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 TUBD1Q9UJT1 453 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PSAT1Q9Y617 370 aa22.98■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 A0A0J9YVX5 310 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 OR2A25A4D2G3 310 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 B8ZZF3 427 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 NRP2O60462 931 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 CCNDBP1O95273 360 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 FDXRP22570 491 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 IL2P60568 153 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 GRM7Q14831 915 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 FAM69BQ5VUD6 431 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ICE2Q659A1 982 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 TTLL10Q6ZVT0 673 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 STRA8Q7Z7C7 330 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 THAP4Q8WY91 577 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 DHRS4Q9BTZ2 278 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 CDC23Q9UJX2 597 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PDE10AQ9Y233 779 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PADI2Q9Y2J8 665 aa22.97■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 FER1L5A0AVI2 2057 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 IMPA1P29218 277 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PGGT1BP53609 377 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PLTPP55058 493 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 SP140Q13342 867 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 SLC9A5Q14940 896 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 WASHC2DQ5SRD0 308 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 FRMPD2BQ6IN97 320 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 RNF44Q7L0R7 432 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC138Q96M89 665 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF285Q96NJ3 590 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 OLFM1Q99784 485 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 PARVBQ9HBI1 364 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 CUTCQ9NTM9 273 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 ANKMY1Q9P2S6 941 aa22.96■■□□□ 1.27
SMKR1-201ENST00000462322 SLC16A5O15375 505 aa22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 SAT1P21673 171 aa22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 GCGRP47871 477 aa22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ABATP80404 500 aa22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CAV1Q03135 178 aa22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 FBXO42Q6P3S6 717 aa22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 A0A1B0GX78 115 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 RFPL1O75677 317 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN12O95859 305 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 CD63P08962 238 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 HIST1H2ADP20671 130 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 SSTR1P30872 391 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PMS2P54278 862 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 FAM214AQ32MH5 1076 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 PAQR7Q86WK9 346 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 OR4N4Q8N0Y3 316 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF592Q92610 1267 aa22.94■■□□□ 1.26
SMKR1-201ENST00000462322 ABHD17AQ96GS6 310 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms