RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 POLEQ07864 2286 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 H7C0C1 242 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SOCS6O14544 535 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TMPRSS2O15393 492 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LRRTM2O43300 516 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PSTPIP1O43586 416 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 B3GALT4O96024 378 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HBQ1P09105 142 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TPH1P17752 444 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ITGALP20701 1170 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ACRV1P26436 265 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ATP5OP48047 213 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 Q0VFX4 171 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 BRD3Q15059 726 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ODF2Q5BJF6 829 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 AADACL2Q6P093 401 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GPR135Q8IZ08 494 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 AMER2Q8N7J2 671 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GRHL3Q8TE85 626 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PTERQ96BW5 349 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ULK4Q96C45 1275 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IP6K3Q96PC2 410 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0J9YY10 115 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 OR51F1A6NGY5 319 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 H7C0S8 307 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 AGPSO00116 658 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PEX12O00623 359 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZG16O60844 167 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MFAP3LO75121 409 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ANXA9O76027 345 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CRTAMO95727 393 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 APOC2P02655 101 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 RALBP11234 206 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PCSK2P16519 638 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MCM3P25205 808 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TERF1P54274 439 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HADHBP55084 474 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 RPA4Q13156 261 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KCNMB1Q16558 191 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GPR33Q49SQ1 333 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KCTD11Q693B1 232 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ACTL9Q8TC94 416 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC42Q96M95 316 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MENTQ9BUN1 341 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 EURLQ9NYK6 297 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 INTUQ9ULD6 942 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.28□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CENPEQ02224 2701 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 LRBAP50851 2863 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXD8-202ENST00000429017 KCNN4O15554 427 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms