RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 BRF2Q9HAW0 419 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 MAP10Q9P2G4 905 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-204ENST00000425660 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.7□□□□□ -0.06
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ACTB-204ENST00000425660 C6orf163Q5TEZ5 329 aa14.69□□□□□ -0.06
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ACTB-204ENST00000425660 FAM170BA6NMN3 283 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-204ENST00000425660 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-204ENST00000425660 LPCAT2Q7L5N7 544 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-204ENST00000425660 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-204ENST00000425660 A0A0C4DFX4 3053 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 CCDC154A6NI56 674 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FXYD1O00168 92 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 PRPS2P11908 318 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 THOP1P52888 689 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 FOXM1Q08050 763 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-204ENST00000425660 LAPTM5Q13571 262 aa14.67□□□□□ -0.06
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