RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SOCS5O75159 536 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PGLSO95336 258 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJB13P59910 316 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFA5Q16718 116 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 KCT2Q8NC54 265 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TAPBPLQ9BX59 468 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF11Q9Y3C5 154 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 DGKEP52429 567 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 IL18Q14116 193 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC14L1Q92503 715 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 IRF7Q92985 503 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PDCD10Q9BUL8 212 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PGRP06401 933 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ARFIP1P53367 373 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SIX5Q8N196 739 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TP53INP1Q96A56 240 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT8Q9NY28 637 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0J9YVX5 310 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 OAS1P00973 400 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 CHRNA1P02708 482 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 HLA-EP13747 358 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 GRK6P43250 576 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 DSC3Q14574 896 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PMEPA1Q969W9 287 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 NDUFS4O43181 175 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL24Q6TFL4 600 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PLET1Q6UQ28 207 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 FRRS1Q6ZNA5 592 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 CD244Q9BZW8 370 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PDLIM1O00151 329 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 OPN1SWP03999 348 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 WNT7BP56706 349 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 IL18R1Q13478 541 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC25A24Q6NUK1 477 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 OR51V1Q9H2C8 321 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PROZP22891 400 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 EMX2Q04743 252 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SP140Q13342 867 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ABHD13Q7L211 337 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 IFT27Q9BW83 186 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 MOCS1Q9NZB8 636 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ALPPL2P10696 532 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 GALK1P51570 392 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHL31Q9H511 634 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ATXN10Q9UBB4 475 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SEPHS1P49903 392 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SPANXN4Q5MJ08 99 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 GIMAP2Q9UG22 337 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PHF11Q9UIL8 331 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNK6Q9Y257 313 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC10A3P09131 477 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 CLDN10P78369 228 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 AMZ1Q400G9 498 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ATCAYQ86WG3 371 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 LGI4Q8N135 537 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM40Q8WWA1 233 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX13Q92968 403 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 OTUB2Q96DC9 234 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 OMA1Q96E52 524 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRJ-201ENST00000418331 ING4Q9UNL4 249 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms