RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 BTBD19C9JJ37 291 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CREG1O75629 220 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ASGR1P07306 291 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C1QTNF8P60827 252 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DLK2Q6UY11 383 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PQLC3Q8N755 202 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 COX18Q8N8Q8 333 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GPR151Q8TDV0 419 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C5orf51A6NDU8 294 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 VIPP01282 170 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ACSL1P33121 698 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 VLDLRP98155 873 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SP140Q13342 867 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MYLK3Q32MK0 819 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC37A3Q8NCC5 494 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PYURFQ96I23 114 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TRBC2A0A5B9 178 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRH1P02810 166 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ACVR2AP27037 513 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CMPK1P30085 196 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 AP1S1P61966 158 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ODF4Q2M2E3 257 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GPR22Q99680 433 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CBX5P45973 191 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 BDKRB1P46663 353 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 OR1E2P47887 323 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 KHKP50053 298 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ADAM8P78325 824 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MOGQ16653 247 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DEC1Q9P2X7 70 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LDB2O43679 373 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RFPL1O75677 317 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DSTNP60981 165 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GPR68Q15743 365 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FXYD6Q9H0Q3 95 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CST11Q9H112 138 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 AASSQ9UDR5 926 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 NUP50Q9UKX7 468 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF6Q9Y252 685 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PAX3P23760 479 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DIO3P55073 304 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CHRNA6Q15825 494 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXL22Q6P050 247 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TMC8Q8IU68 726 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LCN9Q8WX39 176 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 KXD1Q9BQD3 176 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 YES1P07947 543 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRPS1L1P21108 318 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF773Q6PK81 442 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PHC2Q8IXK0 858 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C12orf66Q96MD2 445 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C14orf119Q9NWQ9 140 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HPF1Q9NWY4 346 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.87□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ABCB7O75027 752 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNA5P22460 613 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 S100GP29377 79 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CRISP3P54108 245 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PPP3R1P63098 170 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FRMD6Q96NE9 622 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HAPLN3Q96S86 360 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2AT4A6NND4 320 aa14.86□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CLUP10909 449 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms