RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PASKQ96RG2 1323 aa2.64□□□□□ -1.99
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RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A2Q01362 244 aa2.61□□□□□ -1.99
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